Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF9BQ9UPX0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms