Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRQQ9UN88 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRQQ9UN88 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GABRQQ9UN88 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRQQ9UN88 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRQQ9UN88 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRQQ9UN88 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRQQ9UN88 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRQQ9UN88 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRQQ9UN88 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRQQ9UN88 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms