Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms