Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PADI3Q9ULW8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PADI3Q9ULW8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PADI3Q9ULW8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PADI3Q9ULW8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI3Q9ULW8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI3Q9ULW8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms