Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms