Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms