Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP8AP2Q9UKL3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP8AP2Q9UKL3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms