Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms