Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms