Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIMS3Q9UJD0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms