Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms