Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms