Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM8A1Q9UBU6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms