Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KB2Q9UBS0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KB2Q9UBS0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KB2Q9UBS0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KB2Q9UBS0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KB2Q9UBS0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPS6KB2Q9UBS0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS6KB2Q9UBS0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KB2Q9UBS0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KB2Q9UBS0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KB2Q9UBS0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KB2Q9UBS0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KB2Q9UBS0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KB2Q9UBS0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KB2Q9UBS0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KB2Q9UBS0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KB2Q9UBS0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms