Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP9

GULP1, PTB domain-containing engulfment adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GULP1Q9UBP9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GULP1Q9UBP9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GULP1Q9UBP9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms