Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1BQ9P298 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms