Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC46.32■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC46.32■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC46.32■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC46.31■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.29■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC46.29■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC46.28■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC46.27■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC46.27■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC46.27■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC46.26■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC46.26■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
CCDC180Q9P1Z9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC46.24■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC46.22■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC46.21■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.21■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
CCDC180Q9P1Z9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC46.19■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC46.19■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC46.19■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms