Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4Q9P0V3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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