Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX16Q9P0S2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms