Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFY2Q9P0M6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFY2Q9P0M6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFY2Q9P0M6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFY2Q9P0M6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFY2Q9P0M6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFY2Q9P0M6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFY2Q9P0M6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2AFY2Q9P0M6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2AFY2Q9P0M6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2AFY2Q9P0M6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFY2Q9P0M6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2AFY2Q9P0M6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms