Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms