Protein–RNA interactions for Protein: Q9P021

CRIPT, Cysteine-rich PDZ-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIPTQ9P021 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIPTQ9P021 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms