Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms