Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms