Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM9Q9NXL9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM9Q9NXL9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms