Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms