Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms