Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC28Q9NX36 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms