Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT4Q9NX09 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms