Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK4Q9NVE7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANK4Q9NVE7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms