Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms