Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHDC1Q9NTX5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC1Q9NTX5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECHDC1Q9NTX5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms