Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRTAC1Q9NQ79 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms