Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRC4Q9NPP4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms