Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms