Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms