Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI0

PARVG, Gamma-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVGQ9HBI0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVGQ9HBI0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVGQ9HBI0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVGQ9HBI0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVGQ9HBI0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVGQ9HBI0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVGQ9HBI0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVGQ9HBI0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVGQ9HBI0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVGQ9HBI0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVGQ9HBI0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVGQ9HBI0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms