Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAS3Q9H6U6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms