Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP3Q9H6T3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RPAP3Q9H6T3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP3Q9H6T3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms