Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP44Q9H0E7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP44Q9H0E7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms