Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms