Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTR3CQ9C0K3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms