Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCL11BQ9C0K0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
BCL11BQ9C0K0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms