Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER1Q9C0I3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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