Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms