Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms