Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NLRP1Q9C000 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms