Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ4

SLC25A39, Solute carrier family 25 member 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39Q9BZJ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC25A39Q9BZJ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A39Q9BZJ4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms