Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIFKQ9BYG3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms