Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
FANCD2Q9BXW9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
FANCD2Q9BXW9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC38.57■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
FANCD2Q9BXW9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FANCD2Q9BXW9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FANCD2Q9BXW9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
FANCD2Q9BXW9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms